浙大團隊《Nature》發(fā)文,世界首個人類細胞圖譜成功繪制
該研究團隊的成果建立了人類細胞圖譜的基本框架。
近日,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細胞與再生醫(yī)學(xué)中心郭國驥團隊與浙江大學(xué)附屬醫(yī)院張丹團隊、王偉林團隊、陳江華團隊、梁廷波團隊和黃河團隊等聯(lián)合在《Nature》上發(fā)表研究成果,該成果名為“Construction of a Human Cell Landscape at Single-cell Level”,論文顯示該團隊成功繪制了世界首個人類細胞圖譜。
圖 | 一張單細胞水平的人類細胞圖譜
據(jù)了解,該研究團隊對60種人體組織樣品和7種細胞培養(yǎng)樣品進行了Microwell-seq高通量單細胞測序分析,系統(tǒng)性地繪制了跨越胚胎和成年兩個時期,涵蓋八大系統(tǒng)的人類細胞圖譜。
研究過程中,團隊已經(jīng)建立了70多萬個單細胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,并鑒定了人體100余種細胞大類和800余種細胞亞類。同時,他們也開發(fā)了scHCL單細胞比對系統(tǒng)用于人體細胞類型的識別,搭建了人類細胞藍圖網(wǎng)站。
通過這一研究,團隊建立了人類細胞圖譜的基本框架,發(fā)現(xiàn)成人非免疫細胞的廣泛免疫激活,提出內(nèi)干細胞和祖細胞的分化過程是一個細胞基因表達從混亂到有序的過程,并認為基因組中的調(diào)節(jié)子預(yù)先決定了分化終端的穩(wěn)定狀態(tài)。
針對圖譜對醫(yī)學(xué)臨床的幫助,郭國驥表示,“我們現(xiàn)在建立的是正常細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)庫,可以用于再生醫(yī)學(xué)種子細胞的鑒定。未來如推廣到疾病細胞圖譜,便有可能運用到疾病的單細胞水平診斷上。細胞圖譜的數(shù)據(jù)對于理解疾病的發(fā)生有重要意義,但臨床治療方面的應(yīng)用尚需要更多的積累!
另外圍繞成果本身,郭國驥也說到,“我們的工作在測序深度和細胞數(shù)目上都存在局限性,但是在跨組織和跨物種的數(shù)據(jù)可比性上有較大優(yōu)勢。完美版的人類細胞圖譜還應(yīng)該整合空間信息、多組學(xué)數(shù)據(jù)和人群分析,這需要全世界科學(xué)家的共同努力。”

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